Вы правы. Начальник производства единолично не уполномочен решать вопрос о соответствии работника занимаемой должности и при этом уменьшать ее  заработную плату.

Как правило, квалификация представляет собой уровень подготовленности, мастерства, степень годности работника к выполнению труда по определенной должности или профессии, определяемый разрядом, классом, званием и другими категориями. Квалификация принимаемого на работу лица устанавливается по документам об образовании, документам, подтверждающим опыт работника по должности (профессии), на которую он принимается. В ходе работы квалификация работника устанавливается посредством аттестации, которая проводится для определения соответствия работника занимаемой должности, а также в целях повышения ответственности работников за результаты своей работы.

Порядок проведения аттестации устанавливается трудовым законодательством и иными нормативными правовыми актами, внутренними локальными нормативными актами, принимаемыми с учетом мнения представительного органа работников.

Несоответствие работника должно подтверждаться конкретными фактами (актами проверок, рапорта непосредственного руководителя, отчеты, материалы аттестации, другие документы, подтверждающие низкое качество работы, выпуск бракованной продукции, невыполнение объема работы, норм выработки и т.п.), которые свидетельствуют о том, что работник не справляется с порученной работой.

Так, к примеру, согласно пункту 28 Постановления Пленума ВС от 17.04.1998 г. N 12 "О применении судами законодательства, регулирующего прекращение трудового договора (контракта)" выводы аттестационной комиссии являются одним из доказательств недостаточной квалификации работника и оцениваются судом в совокупности с другими доказательствами по делу. При этом суды должны проверять соблюден ли установленный порядок проведения самой аттестации.

Таким образом, только по итогам аттестации работодатель может дать оценку квалификации работника, но не начальник производства.