В законодательстве чётко не определено, какая именно сумма заработной платы (сумма до вычета налогов или сумма после вычета налогов) должна быть указана в трудовом договоре.

Условия и размер оплаты труда устанавливаются по соглашению между работодателем и работником с учетом сложности и условий выполняемой работы, профессионально-квалификационных и деловых качеств работника, результатов его труда и хозяйственной деятельности организации в соответствии с действующими у данного работодателя системами оплаты труда. Размер оплаты труда не ограничивается каким-либо максимумом (ст. 246 ТК). Оплата труда не может быть ниже установленного законодательством.

В трудовом договоре в условиях оплаты труда, как правило, указывается оклад, тарифная ставка из штатного расписания. В штатном расписании оклады начисляемые, т.е. указываются до удержания налогов.

Исходя из вышесказанного, рекомендуем указывать оплату труда в трудовом договоре с учетом НДФЛ. Но если вы в трудовом договоре указали зарплату к выплате, то доход работника будет исчисляться не от суммы, указанной в трудовом договоре, а с учетом НДФЛ, который должен входить в оплату труда. То есть вам придется каждый месяц в момент начисления обратным путем рассчитывать доход работника в виде оплаты труда.